国立西南联合大学校旗，整面旗帜呈长方形，图案包括一个紫色的等腰三角形（南开、清华的校色为紫色），高为4尺6寸，底部宽2尺6寸，三角形上有黑色的“国立西南联合大学”字样（北大校色为黑色），三角形上下两腰各镶配一个白色直角三角形。本馆所藏的这面校旗由时任西南联大体育组主任马约翰先生的夫人于1941年亲手绣制，曾在1941年10月10开幕的昆明市第一届全市运动会、1942年1月6日的昆明“倒孔运动”游行、1942年10月10日开幕的昆明市第二届全市运动会等活动中使用过，后来由西南联大学生沈元寿（1943届）带到美国，1998年辗转回到西南联大博物馆，现为国家二级文物。

    国立西南联合大学校旗（1941年）